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NEURONシミュレータ

139 :63:2005/04/14(木) 03:57:27
NEURONとGENESISにおけるコンパートメント接続のお話し

NEURON:
conntct soma(1),dend(0)

GENESIS:
addmsg /cell/dend RAXIAL Ra previous_state
addmsg /cell/soma AXIAL previous_state

GENESISはNEURONに比べると書式がめんどくさい…けども、
同様に膜電位以外(濃度関連)の記述もできるのでNEURONのconnectよりも汎用性大。
というところが、NEURONは膜電位に強く(簡単で)濃度に弱いということみたいですな。
はたまたNEURONはコンパートメントがセグメントに分かれてもいるし、
diffusion表現するのは厳しい(無理?)感じがします。
コンパートメント間(not セグメント)ならparent_connectionでpointerの受け渡しも簡単に書けそうな感じもしますが…

とか言ってみるテスト、経験者いたらレスキボン

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