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【F@H】PCの余力でタンパク質研究!!【折畳】

1 :名無しさん@1周年:02/01/06 17:28
 白血病に続き、タンパク質の組み上がりプロセスを解明する
分散コンピューティング・プロジェクトにもTeam 2chができています。
CPUの空き時間を有効に使うためにも、いっちょう協力するってのはいかが?
正常に折り畳みが起こるケースだけじゃなくて、折り畳み異常についても
シミュレートするのでアルツハイマーや狂牛病の研究にも役立つってさ。

詳しくはTeam 2ch(F@H)のHP
http://www.rr.iij4u.or.jp/~kouwow/
PC板のスレッド
http://pc.2ch.net/test/read.cgi/pc/1003864665/l50
を見てみて。

白血病プロジェクトに続いて、Team 2chを世界一にしよう!(・∀・)

以下関連記事・プレス
↓インテル コーポレーションとスタンフォード大学
アルツハイマー病研究のための新たな貢献活動プログラムを発表
http://www.intel.co.jp/jp/intel/pr/press2001/011019.htm
↓インテル、分散コンピューティングの『折り畳みアットホーム』を支援へ
http://www.hotwired.co.jp/news/news/technology/story/20011022305.html
↓「P2P技術でアルツハイマーや狂牛病を研究」
http://www.watch.impress.co.jp/internet/www/article/2001/1019/p2p.htm

2 :名無しさん@1周年:02/01/06 17:43
面白いとは思うけど、この板だと専門分野直撃の人も多いんじゃないかなあ。
正直いって俺もその周辺分野なので、協力しづらい。白血病の時ですらそう
思ったくらいなので。

ところで、まだ中身読んでないんだけど、何使ってるの? MD?

3 :2:02/01/06 18:10
http://folding.stanford.edu/papers/ZSPHairpin01.pdf
をみてみたら、どうもMDみたいだね。TINKERを改良した、とあるし。OPLSの
パラメータを使ったらしい。

でも、implicitな溶媒を使っているみたいなんだけど、これでちゃんと
シミュレートできるのかな。論文には一応「これで十分」と書いてるけど。

そもそもfoldingのシミュレーション自体それほど信頼性の高いレベル
じゃないしね。あえてやっかみ半分で書けば、この人たちが論文を書く
手助けをするだけ、って気がする。
ただ、興味があるのは事実だな。explicit waterでやればいいのに。

どっちにしろ、俺のような化学板とシミュ板両方を見ている人間は専門
分野にかかっているので、傍観しておきます。

4 :名無しさん@1周年:02/01/06 18:23
タンパク質解明してどうなる?

5 :1:02/01/06 19:59
>>3
MDかどうか調べようとしたら、レスありました。遅くて申し訳ないです。
他人の研究の手助けってのは確かですが、これで将来、助かりうる病人が
いるということを信じながらやっていきたく思います。

 ところで、シミュレーション自体にはあまり詳しくないのですが、
計算結果の信頼性を計るのに、なにか統一された方法ってのはあるの
でしょうか?
 こんど趣味でシミュレーションのプログラムを作ってみたいと
考えているのですが、やっぱ実験と比較するしかないのでしょうか?

>>4
なんか、病気の研究に役立つようですよ。

6 :名無しさん@1周年:02/01/06 23:34
> こんど趣味でシミュレーションのプログラムを作ってみたいと
> 考えているのですが、やっぱ実験と比較するしかないのでしょうか?

だろうね。あるいはシミュレーションから実験を提案して、それが
シミュレーションと一致する、という形でもいいけど。どちらにせよ
実験との比較をしないことにはなんとも。

確かにF@Hが創薬につながるのは事実だけど、だいぶ遠いとも思うな。
学術99:実用1くらいの目で見ておいたほうがいいと思う。まだしもUD
のほうが実用に近いかも。
implicit waterもだけど、静電のカットオフが12Åなのも気になる。

でも、学術としては面白い試みなのは認めるよ。ライバルじゃなければ
参加する価値はあると思う。実用には遠いけど、「遠いからといって
一歩も踏み出さなければ永久に到着しない」。

7 :名無しさん@1周年:02/01/07 18:20
http://folding.stanford.edu/cgi-bin/teampage?q=162

ただいま37位

8 :名無しさん@1周年:02/01/08 20:56
ホシュ

9 :1:02/01/09 00:23
>>6

> 確かにF@Hが創薬につながるのは事実だけど、だいぶ遠いとも思うな。
> 学術99:実用1くらいの目で見ておいたほうがいいと思う。まだしもUD
> のほうが実用に近いかも。

 私個人としては参加のきっかけとなったのがUDよりも、
基礎的な観点で研究を行っているように見えたためです。
実用からは遠くても、応用範囲がとても広く感じられ、
なにかロマンを感じてしまったわけです。(^^*


> でも、学術としては面白い試みなのは認めるよ。ライバルじゃなければ
> 参加する価値はあると思う。実用には遠いけど、「遠いからといって
> 一歩も踏み出さなければ永久に到着しない」。

 暖かくTeam 2chの奮闘を見守って頂ければ嬉しいです。(^^)
2さん、ご自身の研究も頑張ってくださいね。

10 :UDスレじぷし:02/01/09 12:05
やっぱこの板の人は、頭いい人達なんだなぁ。
しみじみと尊敬

11 :S:02/01/10 03:04
>>10
おかま、もとい、おなかまハケーン。 FH.にも愛人作っちまいました(`∀´)。
なんせホンマモンの板だからねー。  立てたと告られた日には大丈夫か?と心配。
やさしく迎えられてヨカタね。  下げ進行で逝くよ!!

というわけでシム板皆さん、ありがとうございます。  プロの方にも刺激に
なれたら本望。  とか言ってる間に帯広畜大異常ブリオン抗体ゲトー?
みゅー、まだ負けないもん。

12 :TAM:02/01/11 01:32
ここの>>1ですが、ハンドルをつけてみました。

>>11
>なんせホンマモンの板だからねー。  立てたと告られた日には大丈夫か?と心配。
>やさしく迎えられてヨカタね。  下げ進行で逝くよ!!

 ヨカタデス・・・。(;;)

 シム板とはいえ、F@Hのライバルにならない異なる分野の方(物理とか工学系)も
大勢いると思います。
自宅PCがヒマだって方、是非とも「異分野の学問」をかじるきっかけとして、
参加してはいかがでしょうか?
世の中には「学際」っていう都合のいい言葉もあるし。
僕自身、>>3に出てきた文献はまったくわかんないですが、少しずつ読んでみるつもりです。
やってみたら、きっと楽しみが増えますよん♪
ヨンドルヤツ、ナカマニ(・∀・)ナレ!!

13 :S:02/01/17 03:21
ちーすっ。  明太子鯖大変っスね。  学術系が多いので口惜しいんすが・・・
..やっぱやってることがアレなんでこの板に本部スレ置きたいんだけどね。
F@H2.0.の日本語FAQ.ケテー版出来たよー。
http://users.goo.ne.jp/nightingalegoo/FAH2/faqj.htm
..ついでにこの手のプロジェクト紹介サイトも。 お金貰えるのもあるんだよ。
http://www2.117.ne.jp/~mat/dcomp/shoukai.htm
.            2ch折り畳み組100人集まりましたです。  これからもヨロシク♪

14 :名無しさん@1周年:02/01/19 01:51
本部スレ置いてもいいんじゃないの?
これだけsage進行で、しかも書き込みがまばらなのにまだ上位40スレから
落ちてないし。
ちょっとは賑わったスレがあってもいいかも。

15 :名無しさん@1周年:02/01/19 11:15
シム板活性化に役立つかもNE!

16 :TAM ◆1nidteJg :02/01/21 01:43
>13 でも一部紹介されておりますが。。。

 Team2chのメンバであるNightingale氏が、F@Hの公式サイトにあるFAQと、
今回のプロジェクトの科学的な解説を和訳してくれました。
「このプロジェクトって、そもそもどんな意味があるの?」トカ
「質問カキコするまでもないけど、ちょっとわかんないことがあるんだよね。」トカ
気になることがあれば、まずはご参照(・∀・)アレ!


科学的な背景 ← 生物の門外漢は取り敢えずいってみれ!お勉強になります。
http://203.174.72.114/nightingalegoo/FAH2/sciencej.htm

FAQ ← ちょっとした疑問があれば、こちらを。
http://203.174.72.114/nightingalegoo/FAH2/faqj.htm


上記2ページのトップページ。ブックマークに入れるならコレを。
http://203.174.72.114/nightingalegoo/index.htm

17 :名無しさん@1周年:02/01/22 10:11
http://ams.milkcafe.to/Asunaro/ART/Flash/0004.html

18 :名無しさん@1周年:02/01/22 23:16
>17
め、名作ぞろいだ。
サゲ

19 :Bioinfo初心者:02/01/24 20:23
Foldingシミュレーションは(分散コンピューティングじゃないけど)
IBMなんかがかなり気合入れてやってるみたいですが、膜タンパクなんかの
プライマリー・シーケンスから実用にたる立体構造を吐き出すものって
本当にできるもんなんでしょうかね?

20 :名無しさん@1周年:02/01/27 01:33
30位age

21 :S ◆.ECpRsec :02/01/29 02:48
ちょち書き込みテストさせてね。
めんたい鯖他いくつかトラブッとるらしい。


22 :生物しらん:02/01/30 22:42
>19
それって、シミュレーションの結果から新たに有用なタンパク質を
合成するっていうことをIBMがやっているってことなの?
イッテルコトガ、チンプンカンプン

23 :名無しさん@1周年:02/01/31 00:29
>>22
いや、IBMがタンパクの合成はしないだろう。
>>19がいっているのは、タンパク質の一次構造(タンパク質は複数のアミノ酸から
できていて、それらがどういう順番で並んでいるか、を記述したのが一次構造)から
三次構造(アミノ酸の順番だけじゃなくて、それらが三次元的にどういう配置にある
か、という情報まで含んだ構造。原子と原子をつなぐ結合はそれなりに自由なので、
たとえ一次構造が決まっていても三次元的に取りうる構造の候補は無限にある)が、
しかもfolding経路まで含めて再現できるか、という問題のことだろう。

で、答えとしてはもちろんできていない。foldingどころか、構造予測もまだまだ。
F@Hはその意味で面白い試みだが、foldingには溶媒も重要なので、implicit water
なのがなあ、って、しつこいか。
いや、ほんとに責任者を小一時間問い詰めたいくらいその点が気になっているのだ。

24 :S ◆.ECpRsec :02/01/31 01:15
>>23 >foldingには溶媒も重要なので、〜
 ををぅ、今日常駐してる板のスレで蛋白質の一次〜三次構造のハナシをかます
予定だったけど・・・やっぱりコッチはレベルめっさ高いっスね。
「implicit water」か・・・なんだろう・・・

25 :名無しさん@1周年:02/01/31 02:09
小一時間、問いつめるならここかな?
http://groups.yahoo.com/group/folding-science


26 :S ◆.ECpRsec :02/01/31 09:14
 にょほほほ、やってみて下さいませ。
本格的なことは外部の者にはヤラせんつーことかな (^^)。

27 : :02/02/01 23:46
http://folding.stanford.edu/cgi-bin/teampage?q=162


28 :S ◆.ECpRsec :02/02/02 06:23
 Yahoo のページにある新しいメッセージでも「水」のこと言ってるみたいな・・・
リンク先の文書見てもサパーリ解らん・・・パンデ先生、出て来て下さいな。

29 :名無しさん@1周年:02/02/02 10:28
パンデ先生じゃないけど。

溶液のシミュレーションを行う場合、溶媒(多くは水)の振る舞いは重要なのだが、
分子数がとにかく多いので、溶媒をタンパク質同様分子として扱うにはマシンパワー
が相当必要になる。
そこで、溶媒をタンパク質を取り囲む「雰囲気」のようなものとして、ひとまとめに
してしまう(当然分子とは違った扱いになる)方法もある。
で、溶媒を全部分子として一つ一つ扱った場合(水では)explicit water、溶媒を
「雰囲気」にしてしまった場合implicit waterと呼ばれる。

ただ、溶媒はfolding問題の最大の鍵を握るとされている(普通に考えたら複雑な
問題なのに自然界では正しくfoldingされているのは溶媒のおかげではないかと
いわれている)ので、はたしてimplicit waterを使っていいのか、というのが
微妙な問題。

30 :名無しさん@1周年:02/02/02 18:40
>>29
MDだけで水分子まで含めたシミュレーションしようと思うと、
それこそ量子コンピュータとか欲しくなりますな(ワラ

うーむ、今しばらくintractableな問題なのか?
でもIBMはそれなりに使える立体構造予測システムは、開発中のスパコン
blue Geneで近年中に解決したる!って豪語してたな、確か。
もちろんできれば凄い。

31 :S ◆.ECpRsec :02/02/03 02:46
>>29 ご教授ありがとうです。なんとなく見えてきたつもりですが・・・
はみゅ、「折り畳み」となると化学じゃなく力学なんすよね。有機化学のさらに幕下レベル
の知識でイキがってる自分にはまだ次元が違う世界だよ・・・知らずにやってた方が幸せ?

>>30 Blue Gene ねぇ。 L型は2005年の完成を予定されているけど、コイツ「200TFLOPS」
なんて化け物みたい。 こんなのでも、256桁の素因数分解に一千万年かかるといわれてる
・・・量子コンピュータなら数十秒とか・・・もう好きにしてくださいな気持ち。 
シリーズの最終目標はぺタフロップスというけど、数十年後のパソコンもこんなのだったり。
 ナノコンピュータとかウェットウェアとか、つくづく面白い時代に生まれたものだなぁ。

32 :名無しさん@1周年:02/02/19 03:14
Michael from F@H here,

Version 2.19 (WinClient & Win Console) are now both up for beta testing at http://folding.stanford.edu/beta. Though we've done extensive local testing, it is still
beta, so let us know of any problems that occur. Linux and OSX betas should be posted
next week.

Cheers,
Michael


33 : ◆Jieny//A :02/02/26 10:46
保守

34 :S ◆6JaqYY2A :02/02/28 20:52
地球シミュレーター稼動記念便乗保守。

35 :S ◆6JaqYY2A :02/03/01 21:29
正規版MAC OSXバージョン登場記念age♪ Linux版もバージョンアップしたかな?
MAC版はグラフィカル版とテキスト版の2種。
OS9版は開発しないという。

36 :名無しさん@1周年:02/03/07 01:48
寝る前保守

37 :名無しさん@1周年:02/03/11 00:15
保守

38 :S ◆6JaqYY2A :02/03/13 02:22
(^^ )保守の必要ないカモしんない・・・この板らしいネタフリしとくかな。
"TINKER"ってプログラムってどういうもんなんだろう?
>>3の人が良く知ってたりするから有名なんかな?
あと "MD"って分子力学?
それにしても "浮動少数点処理"が弱いCPUだと極端にキツイ(´д`)


39 : :02/03/23 23:37
maintenance

40 :名無しさん@1周年:02/04/03 01:36
保守

41 :S ◆6JaqYY2A :02/04/05 06:13
そんなに関係は無いハナシだけど、また先を越されたね、日本。
『イネゲノム解読終了…スイス社と米中チーム』
http://www.yomiuri.co.jp/00/20020405i101.htm
今度も「精度を極める」とうそぶくのかな?


42 :S ◆6JaqYY2A :02/04/11 01:00
 Macさん用の日本語解説サイトが出来てるよー
http://www14.u-page.so-net.ne.jp/gb4/strbery/
 PoppoPoroPoroさんのお仕事でし。 Mac用の表示窓カチョエエ。

マカーさんヨロシコage

43 :名無しさん@1周年:02/04/29 12:29
月末age

44 :名無しさん@1周年:02/05/02 11:45
アルツハイマーの仕組み解明
http://headlines.yahoo.co.jp/hl?a=20020502-00000001-yom-soci


45 :生物屋:02/05/03 02:12
計算機は素人ですがスマソ。
MDって、分子動力学のこと?
それだけでフォールディングなんてほんとに追いかけられるもんなの?
シャペロンとかどうすんだ。


>>41
スイスのはどうせショットガン法で読んでるだろうから、
精度は低かろう、実際。



46 :名無しさん@1周年:02/10/19 03:37
保守

47 :(´・∀・)へ〜:02/10/20 00:20
ここにもあったのか。
って、なんだこのブランクは?

48 :名無しさん@1周年:02/10/25 21:58
ニュー速+にスレが立っていました。
【研究】分散コンピューティングでタンパク質の「折り畳み」現象解明
http://news2.2ch.net/test/read.cgi/newsplus/1035464693/l50


49 :名無しさん@1周年:02/11/05 09:28
アイコンで実行じゃなくて、ファイル名を指定して実行の時に
-advmethodsを使えばいいっす。

Win版でしたらC:\Program Files\Folding@Home←このようにしている方が多いと思いますが。

"C:\Program Files\Folding@Home\winFAH.exe" -advmethods

こんな感じで実行すればOKっす。


50 ::提供教官:02/11/07 22:19
うーむわからん。 Schakhonovichだったか、エネルギー安定な構造がうんとbasinが広くなるように
設計(進化)することは困難ではない ようなことを言ってた気が。。
だとすると そんなにimplicit/explicit water で違いがでるだろうか。 どうやってもエネ最小構造へ到達できそうな気がするが。。

51 :あぼーん:あぼーん
あぼーん

52 :名無しさん@1周年:02/11/17 23:21


53 :名無しさん@1周年:02/11/18 00:35


54 :名無しさん@1周年:02/11/26 21:45
MD(分子動力学法)に GROMACS導入age!!
http://www.gromacs.org/
オランダのグローニンゲン大学で開発 SSE2対応

P533 P534
http://folding.stanford.edu/psummary.html

55 :名無しさん@1周年:03/01/01 23:36
年もあけたわけだが。

56 :山崎渉:03/01/11 05:26
(^^)

57 :名無しさん@3周年:03/02/11 04:23
あげ

58 :山崎渉:03/03/13 13:13
(^^)

59 :山崎渉:03/04/17 09:12
(^^)

60 :山崎渉:03/04/20 04:04
   ∧_∧
  (  ^^ )< ぬるぽ(^^)

61 :名無しさん@3周年:03/05/09 23:59
40万点突破記念age

でも、2〜3日で26位のチームに抜かされるのはもう確定っぽい。

25 Team 2ch 404360.3
26 ForumOC  403548.2

62 :名無しさん@3周年:03/05/09 23:59
あ・・・age!

63 :あぼーん:あぼーん
あぼーん

64 :名無しさん@3周年:03/05/10 01:08


65 :名無しさん@3周年:03/05/14 03:36
宿題提出しますた。

66 :あぼーん:あぼーん
あぼーん

67 :あぼーん:あぼーん
あぼーん

68 :名無しさん@3周年:03/05/19 00:24
宿題提出age

69 :あぼーん:あぼーん
あぼーん

70 :名無しさん@3周年:03/05/19 05:02
800点突破して喜んで来てみたけど…
まあ1月放って置いても落ちない板だから誰もいなくても仕方がないか…

71 :あぼーん:あぼーん
あぼーん

72 :あぼーん:あぼーん
あぼーん

73 :あぼーん:あぼーん
あぼーん

74 :名無しさん@3周年:03/05/21 05:48
>>70
カレードゾー( ゚д゚)ノ●

75 :山崎渉:03/05/21 21:43
━―━―━―━―━―━―━―━―━[JR山崎駅(^^)]━―━―━―━―━―━―━―━―━―

76 :名無しさん@3周年:03/05/23 15:38
なんか新バージョン出たらしいよ。
http://www.stanford.edu/group/pandegroup/folding/reloaded/

77 :名無しさん@3周年:03/05/28 03:23
110番台に突入しますた。
100番切るまでどの位かかるかな…。

78 :_:03/05/28 04:10
http://homepage.mac.com/hiroyuki43/hankaku05.html

79 :名無しさん@3周年:03/05/28 05:32
(´―`)y━~~タバコ代上がるのイヤー
http://www.k-514.com/good/dxlive.html
http://www.k-514.com/good/hgmo.html
http://www.k-514.com/good/jgirlpa.html
http://www.k-514.com/good/tokyonights.html
http://www.k-514.com/good/tokyonights.html
http://www.k-514.com/good/erox.html
http://www.k-514.com/good/goa.html
http://www.k-514.com/good/caribeancom.html
http://www.k-514.com/good/1pondou.html
http://www.k-514.com/good/osikko.html
http://www.k-514.com/good/beikoku.html
(´―`)y━~~タバコ代上がるのイヤー

80 :山崎渉:03/05/28 14:16
     ∧_∧
ピュ.ー (  ^^ ) <これからも僕を応援して下さいね(^^)。
  =〔~∪ ̄ ̄〕
  = ◎――◎                      山崎渉

81 :t-akiyama:03/06/01 13:41
携帯ゲーム機"プレイステーションポータブル(PSP)

 このPSPは、新規格UMD(ユニバーサルメディアディスク)というディスクを利用しており、そのサイズは直径6cmととても小さい(CDの半分程度)。 容量は1.8GBとなっている。
画面は4.5インチのTFT液晶で、480px x 272px(16:9)。MPEG4の再生やポリゴンも表示可能。外部端子として、USB2.0とメモリースティックコネクタが用意されているという。

この際、スク・エニもGBAからPSPに乗り換えたらどうでしょう。スク・エニの場合、PSPの方が実力を出しやすいような気がするんですが。
任天堂が携帯ゲーム機で圧倒的なシェアをもってるなら、スク・エニがそれを崩してみるのもおもしろいですし。かつて、PS人気の引き金となったFF7のように。

82 :名無しさん@3周年:03/06/15 01:41
また次のチームがすぐ後ろに迫ってるよ。
抜かれる日も遠く無さそうってことで、参加者募集上げ!

83 :名無しさん@3周年:03/06/17 13:08
またひとつ抜かされますた。

24 3     Germany        555086.1
25 49    ForumOC        539579.7
26 13854 General [M]ayhem 523600.8
27 162   Team 2ch       519340.9  <ココ
28 1971   Team MacOS X   499365.4

参加者募集。

84 :777:03/06/17 15:30
http://my.vector.co.jp/servlet/System.FileDownload/download/ftp/0/287703/pack/win95/game/table/pachinko/majomika.lzh

http://my.vector.co.jp/servlet/System.FileDownload/download/ftp/0/281853/pack/win95/game/table/pachinko/SUTING.LZH

85 :名無しさん@3周年:03/07/13 07:28
何だかわからない物に保守されてる…

86 :名無しさん@3周年:03/07/13 08:11
http://coolnavi.com/~niku/cgi-bin/img-box/img20030713184251.jpg

87 :_:03/07/13 08:45
http://homepage.mac.com/hiroyuki44/2ch.html

88 :_:03/07/13 09:06
http://homepage.mac.com/hiroyuki44/

89 :山崎 渉:03/07/15 12:39

 __∧_∧_
 |(  ^^ )| <寝るぽ(^^)
 |\⌒⌒⌒\
 \ |⌒⌒⌒~|         山崎渉
   ~ ̄ ̄ ̄ ̄

90 :名無しさん@3周年:03/07/24 04:07
参加者募集上げ

荒しさんに保守されまくってる。(汗)

夏休みのせいかイマイチ宿題の集まりが悪いでつ…。
また抜かされそうな悪感。

http://www.statsman.org/folding2stats/html/162.html

91 :_:03/07/24 04:12
http://homepage.mac.com/hiroyuki44/hankaku10.html

92 :名無しさん@3周年:03/07/24 11:32
                \ │ /
                 / ̄\   / ̄ ̄ ̄ ̄ ̄
               ─( ゚ ∀ ゚ )<   タンパクー!!!
                 \_/   \_____
                / │ \
                    ∩ ∧ ∧  / ̄ ̄ ̄ ̄ ̄ ̄ ̄ ̄ ̄ ̄
 ̄ ̄ ̄ ̄ ̄ ̄ ̄ ̄\∩ ∧ ∧ \<ヽ゚∀゚>< タンタン麺---!!!!!!
 タンパク-!!!!!!      >( ゚∀゚ )/ |    / \__________
________/ |    〈 |   |
              / /\_」 / /\」
               ̄     /_/



93 :名無しさん@3周年:03/07/24 18:34
タンタン麺はウリナラ起源ですか?

94 :山崎 渉:03/08/02 02:24
   ∧_∧
  (  ^^ )< ぬるぽ(^^)

95 :ぼるじょあ ◆yBEncckFOU :03/08/02 02:58
     ∧_∧  ∧_∧
ピュ.ー (  ・3・) (  ^^ ) <これからも僕たちを応援して下さいね(^^)。
  =〔~∪ ̄ ̄ ̄∪ ̄ ̄〕
  = ◎――――――◎                      山崎渉&ぼるじょあ

96 :名無しさん@3周年:03/08/14 05:00
保守ご苦労。(w

97 :山崎 渉:03/08/15 17:50
    (⌒V⌒)
   │ ^ ^ │<これからも僕を応援して下さいね(^^)。
  ⊂|    |つ
   (_)(_)                      山崎パン

98 :名無しさん@3周年:03/09/02 05:16
よっこいしょ

99 :名無しさん@3周年:03/09/28 01:08
4000点越え&宿題111回提出記念マキコ♪
シュミレート板でも蛋白質のシュミレーションは人気ないんかねぇ。

それにしても、ここって本当に落ちない板だなあ…。


100 :名無しさん@3周年:03/10/07 12:47
また1チームに抜かされますた。
現在32位。

http://folding.extremeoverclocking.com/team_overview.php?TeamID=162

参加者募集age。

101 :名無しさん@3周年:03/10/10 21:59
参加者募集age

102 :名無しさん@3周年:03/10/18 01:06
モ鳩とSMAPにスレが立ったもよりです。

娘。(鳩)
http://ex2.2ch.net/test/read.cgi/zurui/1066237736/l50
スマ板
http://tv2.2ch.net/test/read.cgi/smap/1066237504/l50

そのおかげか過去1週間で参加者が7人増えましたよ。

hajidon          2003-10-11
stayhigh         2003-10-11
yzzy           2003-10-11
Tomoya         2003-10-12
S2000-NEKO-XEON 2003-10-13
K.W.            2003-10-15
koniph          2003-10-16

あなたの参加もお待ちしております。

103 :名無しさん@3周年:03/11/09 00:56
チームランキング@ 2003.11.9 0:30
  ランク   チーム名                 ポイント                総提出回数
                    (過去24時間)  (過去1週間)    (Total)
   30  Team MacOS X      7,566.04     51,266.96   1,235,183.62      107,171
   31  kcgeek            2,925.30     25,238.17   1,169,395.00       77,733
   32  Team 2ch          6,042.98     37,215.39   1,143,889.75       74,351
   33  LITTLEWHITEDOG      6,891.12     44,526.68   1,112,775.38       42,880
   34  ForumOC          2,939.31     20,676.61   1,026,854.25       86,801

過去1週間の新規参加者 (いらっしゃ〜い)
   ID              参加日時
  _R(_M_D_L)      2003-11-01 12:00:00
  Radio110       2003-11-01 15:00:00
  yasukuni        2003-11-02 06:00:00
  Tako-soft       2003-11-03 12:00:00
  niiya          2003-11-07 09:00:00

過去一週間でのキリ番超え (おめでとうございます)
   ID             キリ番
  amue              1,000
  kibi               1,000
  nya               1,000
  saba5hiki            1,000
  Helium             5,000
  marony             5,000
  namako13           10,000
  NEAN             10,000
  LotusEuropaSP       20,000
  BJFC_(volley)         30,000
  pretty_ru_chan        50,000

104 :名無しさん@3周年:03/11/16 01:39
過去1週間の新規参加者 (いらっしゃ〜い)
   ID              参加日時
  mirage_5     2003-11-09 03:00:00
  momokuri_3   2003-11-09 03:00:00
  hybrist      2003-11-09 09:00:00
  nicotine      2003-11-09 09:00:00
  a_knot       2003-11-10 00:00:00
  kerorin_ver3   2003-11-10 06:00:00
  dyn-fu       2003-11-10 09:00:00
  sat         2003-11-12 06:00:00
  syazaisiru     2003-11-13 00:00:00
  1/5         2003-11-13 12:00:00
  radio        2003-11-14 12:00:00
  takayuki      2003-11-14 18:00:00
  Kon         2003-11-14 21:00:00

過去一週間でのキリ番超え (おめでとうございます)
   ID             キリ番
  nobuo            40,000
  abend            30,000
  Princess_Silver       10,000
  mets              5,000
  pinepudding          5,000
  tropico            5,000
  furaute            1,000
  Radio110           1,000
  takaaki            1,000

105 :名無しさん@3周年:03/11/16 01:39
チームランキング@ 2003.11.16 1:00
  ランク   チーム名                 ポイント                総提出回数
                    (過去24時間)  (過去1週間)    (Total)
   30  Team MacOS X      8,096.71    53,683.29   1,288,867.25      108,220
   31  kcgeek            2,801.25    24,302.76   1,193,697.50       78,240
   32  Team 2ch          5,469.15    39,225.74   1,183,115.88       75,243
   33  LITTLEWHITEDOG     6,330.71    44,267.22   1,157,042.88       43,874
   34  ForumOC          2,056.03    19,086.32   1,045,940.50       87,237


106 :名無しさん@3周年:03/12/06 03:30
参加者募集中

107 :名無しさん@3周年:04/01/27 15:02
このいたすごすぎ。
良くスレが落ちないよな…。

http://folding.extremeoverclocking.com/team_overview.php?TeamID=162

108 :名無しさん@3周年:04/02/01 19:27
参加したいです。どうすればいいですか?

109 :名無しさん@3周年:04/02/01 21:57
参加方法
http://www.stanford.edu/group/pandegroup/folding/download.html  で
ダウンロードしたら早速開始して名前を登録、
チーム番号に162と入れればチーム2chに入れます。
あとは勝手にやってくれます。
名前を決めるときは、上記ダウンロードサイトで既に使われてないか確認しましょう。
(日本語はバケる可能性あり)

日本語翻訳ページ
http://latitude.jp/fah/folding_j/

メインスレ
【パソコン一般板】Folding@Homeで蛋白質解析 Part3
http://pc3.2ch.net/test/read.cgi/pc/1073995038/l50

110 :名無しさん@3周年:04/05/23 19:08
まだ落ちてなかったのか

111 :名無しさん@3周年:04/05/30 02:37
111

112 :名無しさん@3周年:04/11/07 20:19:58
http://society3.2ch.net/test/read.cgi/volunteer/1099826106/l50

113 :名無しさん@3周年:04/11/07 21:58:13
高分子電解質の挙動なんだから、第一原理でやるのが筋というものだ。



114 :名無しさん@3周年:04/11/21 21:41:53


115 :名無しさん@3周年:05/01/16 16:34:17
応援age

116 :名無しさん@3周年:05/01/17 10:08:02
てs

117 :名無しさん@3周年:05/01/17 11:28:48
■2ちゃんねるで逮捕された人間一覧■
2000.05.03ネオむぎ茶(17)バスジャック。銃刀法違反と人質による強要行為等処罰法違反の疑い
2000.05.12高校2年男子生徒(17)殺人予告後、根岸線で男性をハンマーで殴る。殺人未遂容疑
2000.06.13私立大学3年生(23)「千葉大に殴りこむぜ」と犯行予告。威力業務妨害の疑いで逮捕
2001.02.23無職男性(26)山梨の元上司を実名で掲示板で中傷。名誉棄損容疑で逮捕山梨県
2001.02.23ネオ麦酒(17)札幌YOSAKOIソーラン祭り爆破を予告。脅迫の疑いで補導北海道
2001.02.2312人の男女ヤフオクに不正アクセス、中傷も。 不正アクセス禁止法違反の疑いで逮捕。書類
2001.12.24ラットキラー(16)犯行予告後、新宿で老人に刃物を突きつけ人質に。人質強要処罰法違反
2002.08.06ディルレヴァンガー(27)ネット上で自らが動物虐待した画像を掲載。動物愛護法違反で逮捕
2002.10.25私立大学3年の女(20)24時間テレビ爆破予告。威力業務妨害容疑で逮捕愛知県
2003.02.25中学2年男子生徒(14)氏家町の小学校「生徒を3人殺すことを予告します」と書き込み。脅迫の
2003.03.28ネオ烏龍茶(24)小田急線爆破予告。米国留学中の容疑者に帰国要請をし、威力業務妨の疑
2003.11.08菊鬼(アナルの鬼)元龍貴(43)奈良県警吉野署を騙し、名誉棄損事件を捏造、偽証罪
2004.04.27Master(43)大阪市中央区南船場一丁目十四の七 アインズ南船場1F 飲食店 自営
2003.05.07中浦和の星(17)埼玉県内の小学校名を挙げて22回に渡り、殺人予告。脅迫容疑で逮捕県
2003.07.18高校3年男子生徒(17)田川郡内の高校爆破予告。脅迫の疑いで逮捕福岡県
2003.08.08高校3年男子生徒(17)「小学生を襲撃する」と書き込み。脅迫の疑いで逮捕大阪府
2003.08.18中学2年男子生徒(13)「小学生23人を殺す」と殺人予告。脅迫の疑いで補導岩手県
2003.09.17私立大4年生(21)日本代表の敗退に腹を立て、成田空港に対し爆破予告。威力業務
2003.11.05ごるごるもあ(26)米軍基地の爆破を予告。脅迫の疑いで逮捕大阪府



118 :名無しさん@3周年:05/01/21 18:09:06
前代未聞】■奈良県警吉野署を騙した男★元龍貴■
大阪市中央区南船場の一丁目14の7番アインズビル南船場一階コンタクトという
飲食店自営の元龍貴は、2ちゃんねる武道板運営人で、スレッド削除や閉鎖できる身分で
ありながら、自分が書き込みした誹謗中傷を隠ぺい工作し、一方的に誹謗中傷された
「被害者」を装って、2ch住人を訴え逮捕までさせていた事件が明るみにでた。
それらの事実は、奈良県警吉野署にある元龍貴の事情調書として完全に保存されており
もしこれが本当なら、これほど明確な証拠はない。尚、元龍貴はその後も約2年間に
わたって、2ちゃんねるの過去ログや悪徳商法マニアックスをも巻き込み、逮捕させた
者の住所 実名を2年以上もの間晒し続け嫌がらせするという悪質なる犯罪行為が
継続中あり、その他の事件としても○ヤフー掲示板では、タイへの海外旅行客に
詐欺・脅迫・買春斡旋・ピンハネ行為買春現場写真を奥さんに送りつけるとの脅迫。
○運営の権限を乱用しての、空手団体白蓮会館への名誉毀損誹謗やその関係者の
職場である愛媛県庁職員への実名での誹謗中傷事件。など数多くの凶悪悪質陰湿
な余罪がある。元龍貴が2ちゃんねるの武道板管理運営(プロ固定)であるという証拠は、
現在数十個以上保存 されているようで、これらすべてが事実であれば実刑まで 食らう
確立はかなり高いだろう。今後の事件の経過が楽しみである。↓ 犯罪現場ヤフー掲示板
http://messages.yahoo.co.jp/bbs?.mm=GN&action=l&board=1835401&tid=a5pa5sa53a5afa4ga5sa1bca5ka4ga4b0fba4dfa4dea4bba4sa4aba1a9&sid=1835401&mid=7145


119 :名無しさん@3周年:05/02/04 02:06:45
応援age

120 :ぼるじょあ ◆yBEncckFOU :05/02/20 09:23:23
                                         
     ∧_∧  ∧_∧                             
ピュ.ー (  ・3・) (  ^^ ) <これからも僕たちを応援して下さいね(^^)。
  =〔~∪ ̄ ̄ ̄∪ ̄ ̄〕                             
  = ◎――――――◎                      山崎渉&ぼるじょあ
                                          

121 :山.崎 渉:05/02/22 19:39:10
...これからも僕を応援して下さいね(^^)。   
  
━―━―━―━―━―━―━―━―━[JR山崎駅(^^)]━―━―━―━―━―━―━―━―━―
         
     ∧_∧
ピュ.ー (  ^^ ) <これからも僕を応援して下さいね(^^)。                         
  =〔~∪ ̄ ̄〕                                            
  = ◎――◎                      山崎渉                       
                                
 __∧_∧_                                                 
 |(  ^^ )| <寝るぽ(^^)      
 |\⌒⌒⌒\                                
 \ |⌒⌒⌒~|         山崎渉             
   ~ ̄ ̄ ̄ ̄                            
                            
   ∧_∧                                       
  (  ^^ )< ぬるぽ(^^)      
                                                       
    (⌒V⌒)                    
   │ ^ ^ │<これからも僕を応援して下さいね(^^)。   
  ⊂|    |つ                                
   (_)(_)                      山崎パン 
                                         
     ∧_∧  ∧_∧
ピュ.ー (  ・3・) (  ^^ ) <これからも僕たちを応援して下さいね(^^)。
  =〔~∪ ̄ ̄ ̄∪ ̄ ̄〕                          
  = ◎――――――◎                      山崎渉&ぼるじょあ

122 :名無しさん@3周年:2005/08/23(火) 05:24:24
ほっしゅ

123 :名無しさん@5周年:2005/09/19(月) 19:25:46
age

124 :名無しさん@5周年:2005/12/08(木) 07:25:53
age

125 :名無しさん@5周年:2005/12/10(土) 05:30:22
凄いなこのスレ、長い・・・

F@H、ここのリンクで始めて論文読んだけど(Abstractだけ)、1報目の題名がすげーうれしそうw
もうこのスレ立ってから3年も経つから
シミュレーション方も大分変わってるんだろうな。
誰か知ってる人いたら、今どんなことやってるか教えて下さい。
分散コンピューティング自体普及してきたりしてるのかな?

126 :名無しさん@5周年:2005/12/30(金) 16:51:30
>>125
ttp://folding.stanford.edu/japanese/faq.html
ここの一番上に現在解析に使われているcodeの簡単な説明があります。
論文を読める方なら英語ページを見たほうが良いかも。
分散コンピューティング自体はUDやSETI@Homeなど、かなり普及して
きているのではないでしょうか。


127 :名無しさん@5周年:2006/02/26(日) 00:24:41
保守。

128 :名無しさん@5周年:2006/04/06(木) 14:23:46
>>125
シミュレーション法が変わってるかどうかは英語読んでないので知らないけど、
2003年前後からSSE必須のクライエントになった。
たまにはSSE2を使うものもあるみたいで、
これはCPUとOSを64bit化しても無意味であり、
Windowsでもlinuxでもとにかくフツーに
SSEやSSE2を実装した32bitチップで十分ということらしい。

このスレの住人なら分かりきったことなんだろうけど(自分はlinux板と自作板住人)、
要するにシミュレートは浮動小数点演算で主にやるんで、
整数演算能力を上げてもあんまり意味ないので、
64bit用のクライエントをそもそも作ってないそうです。

129 :名無しさん@5周年:2006/05/06(土) 00:18:00
君のPCパワーをシミュレーション研究に!!

応援頼む。
(悪いけど)ヴォランティア板の人たちのマシンパワーじゃアテにならんしな。

130 :名無しさん@5周年:2006/07/12(水) 21:10:13
             \        .∧_∧                  /
              \   ピュ.ー (  ^^ )<これからも僕を  /     ∧_∧
 山崎渉は      \   =〔~∪ ̄ ̄〕          /∧_∧  ( ^^  )
    かっこいい。     \ .= ◎――◎            / . (  ^^ ) /   ⌒i
           从// . \     ∧∧∧∧     /.  /   \     | |
   (  ^^ )     n      \  <.      >.. /.   /    / ̄ ̄ ̄ ̄/ |
  ̄     \    ( E)      \< の 山. >/.   __(__ニつ/  山崎  / .| .|
 フ     /ヽ ヽ_//         < 予.    >.         \/       / (u
―――――──―――――――< 感 崎. >―――――──―――――――
                      <. !!!.    >
        山崎渉age(^^)   <     渉. >  1 名前:山崎渉 投稿日:02/
    ∧_∧.             /<..     >\    (^^)
  ∧(  ^^ ).           /   ∨∨∨∨.   \
 ( ⊂    ⊃.        /                  \  3 名前:山崎渉 投稿
 ( つ ノ ノ       /. ―━[JR山崎駅(^^)]━― \.    >>2
 |(__)_)     /                     \   (^^;
 (__)_)      /. ―━―━[JR新山崎駅(^^)]━―━― \
         ./                            \

131 :名無しさん@5周年:2006/07/26(水) 10:00:15
14 niiya 205248 1454
15 Tiger 192715 1953
16 Aqua 185556 3247
17 pretty_ru_chan 173795 5774
18 hide-oh 172691 863
19 rikidouzan 156980 1393
20 A-GLOBALNET.CO.JP 150305 1222
21 kosyan 134712 1586
22 toroyanof 134681 832
23 Lain_Liar 134181 1130
24 Char_Aznable 133820 794
25 gi-ku 129088 1528
26 satellitesat 126725 564
27 ucchy 123034 1339
28 B4U 118872 3500
29 rontai 118707 1185
30 abend 115771 2509
31 ponkiti_the3rd 114699 865
32 (^_-)res184(^^) 109979 762
33 serioussamantha 108382 963
34 ShigA 100664 1070

132 :名無しさん@5周年:2006/08/25(金) 02:59:23
PS3がF@Hに参加する事が決定したらしい。
もうすでに ゲーム機じゃないな

http://japanese.engadget.com/2006/08/23/ps3-folding-at-home/

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read.cgi ver 05.04.00 2017/10/04 Walang Kapalit ★
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